Enstitü Eskişehir'e 8 km uzaklıkta sulama şebekesi içinde 71.8 hektarlık bir arazide "Bölge Sulu Ziraat Deneme istasyonu " adı ile 1953 yılında kurulmuştur. Sulu tarım araştırmalarının yanı sıra 1962 yılında temin edilen 36.0 hektarlık eğimli arazide toprak ve su muhafazası araştırmaları amacıyla kuru tarım çalışmalarına başlamış ve adı " TOPRAKSU Araştırma Enstitüsü " olarak değiştirilmiştir.1984 yılında yapılan düzenleme ile ismi " Köy Hizmetleri Eskişehir Araştırma Enstitüsü " olarak belirlenmiştir. Haziran / 2005 yılında ismi " Toprak ve Su Kaynakları Eskişehir Araştırma Enstitüsü " olarak değiştirilmiştir. Enstitümüz araştırma faaliyetlerinin amacı Araştırma Master Planı'nda görev tanımı genel olarak olarak belirtildiği gibi;
"Uluslararası standartlarda ve kapsamı iyi tanımlanmış araştırmaların yürütülmesiyle Türkiye'nin toprak ve su kaynaklarının ekonomik ve sürdürülebilir tarımsal kullanımı için katkıda bulunmaktır"

Enstitünün çalışma alanı olarak; Eskişehir, Afyon, Kütahya, Uşak, Bursa, Bilecik, Yalova, Sakarya ve Kocaeli illeri kabul edilmiştir.

Araştırmalar dört Bölüm Başkanlığı altında yürütülmektedir.

•  Havza Yönetimi Bölümü

•  Su Yönetimi Bölümü

•  Toprak Yönetimi Bölümü

•  Yatırım Yönetimi Bölümü 

Bu bölümlere ek olarak enstitü toprak ve su laboratuarı ile alet - makine parkı bulunmaktadır. Araştırma çalışmalarının dışında kalan arazide tarımsal üretim yapılarak döner sermaye vasıtasıyla değerlendirilmek- tedir.

Enstitü 2005 yılına kadar 210 proje uygulamış, bunların 202 adedi sonuçlanmış ve sekiz adedinde ise çalışmalar devam etmektedir. Sonuç raporu, teknik yayın ve çiftçi broşürü olarak 259 adet yayını teknik elemanların ve çiftçilerin hizmetine sunmuştur.